Chuyện kể rằng tại một hòn đảo hẻo lánh có một chú vịt con, chú được một vị phù thuỷ vô danh mang về nuôi dưỡng. Cùng với phụ tá của bà là Nezumi, cả hai đã ân cần chăm sóc chú vịt ấy để nó có thể quên đi cái chết của người thân.

Thời gian dần trôi, nỗi đau ngày nào cũng dần vơi bớt. Khi này, nó bắt đầu để tâm đến cảm xúc của hai vị phụ huynh. Nó bắt đầu tìm hiểu những bí ẩn về hòn đảo, cũng như quá khứ đau thương của vị phù thuỷ vô danh. Để rồi khi biết được sự thật, nó đã bước trên con đường giả kim thuật sư mà người để lại, và viết nên câu chuyện của riêng mình.

Tuy nhiên với vận may đạt đến mức âm của bản thân, liệu nó có thể làm gì để đạt được điều mình mong muốn? "Ahiru The Unavailing Alchemist Is Actually A Duck!" chính là câu chuyện kể về cuộc hành trình đầy gian nan đó.

"Vịt, con hãy đi, để thấy thế giới này vô cùng rộng lớn. Rồi con sẽ có những cuộc gặp gỡ, những câu chuyện về họ sẽ giúp con trưởng thành hơn. Vậy nên, hãy giương đôi cánh của mình và bay thật tự do con nhé. Ahiru..."